Мои комментарии

Отображаются все платежи до даты счёта-фактуры.
На последнем обновлении точно.

Можно. Нужен алгоритм передачи.
То есть программе надо точно указать, что она должна делать.
В одной программе операции будут выгружаться.
Такой бланк в нашей поставке есть.
Во второй будет производиться чтение, обработка и запись операций.
Бланк импорта у нас тоже есть.
Нужен только алгоритм обработки.

Не хочет операционная система создавать базу в корне диска, наверное так.

Для определения АВТОСОХР_СФ поставьте значение НЕТ.
Если такого определения нет, то создайте.
Ошибка связана с копированием базы счетов-фактур при старте программы.
Это рудимент прошлых лет. Сейчас есть возможность создавать архивы всей базы.

1.Расположить базу на другой ВМ было связано с правами пользователей да и BDE всегда был так настроен на локальных ПК, к которым подключался диск с Файл сервера под некой Буквой.

Доводы не очень убедительные, внутри одного Виртуального сервера всегда можно настроить нужные права доступа. В базах удалить все файлы с расширением lck и файл PDOXUSRS.NET, и про букву сразу забыть.

2. Есть железка - Сервер. На нем крутятся разные Виртуальные сервера с разными функциями . Пользователи работают в терминальном режиме.

Вот и пусть работают на одном виртуальном сервере.
Ксть конечно другой путь, изучать матчасть, Александр Вас отправил в нужном направлении.
P.S. У нас таких железяк на обслуживании несколько, своих тоже несколько. Несколько десятков пользователей на одном сервере легко уживаются.

Зачем вообще ВМ, разве без них нельзя?

Кок-то очень мудро.
Зачем базу располагать на второй виртуальной машине?

План счетов, тип цены счета лучше делать "Средняя".
Для 01 счёта можно вообще использовать только суммовой учёт, количество есть в блоке.

например, 20,70,71

К этим счетам надо добавить в видимые счета всю корреспонденцию.
То есть 50, 51,68/НДФЛ и пр.
Иначе отчёт о движении средств будет давать ошибку о не найденном счёте.
Кроме этого, надо сделать разграничение по доступным и видимым рабочим местам.
Это для ограничений по редактированию хозяйственных операций.
Сделать доступным только собственное рабочее место.
В этом случае все пользователи должны заходить только под своими именами.
На таком разграничении можно сделать закрытие периода.
По процедуре закрытие периода можно изменить всем операциям номер рабочего места, добавить например +10 или +20.
Было бы желание.

В сбербанке каждый филиал может установить свой формат!
Поэтому. надо изменять формульную часть под такой филиал индивидуально.

Проверьте скорость работы сетевой карты.
Попробуйте скачать базу ИБ8 на этот компьютер, потом в обратную сторону. Посмотрите на время копирования, сравните с временем на других компьютерах и скорость чтение/запись. Если большие расхождения то поменяйте сетевой вход на коммутаторе, если не помогло, то сетевую карту.

Попробуйте достать из архива, если было настроено копирование в архив.

У вас много позиций в номенклатуре?
Про настройки не знаю, может и нет их вовсе.
У нас есть экспорт в Excel, могу прислать.

На флешке нельзя работать.
У неё ограниченный ресурс по количеству записей, не более 10000 раз.
На ней можно только хранить, но не работать.

Поставить обновление с нашего сайта или по почте.

И какое было название?

Там не "странное" название, там русские буквы в названии. Их быть не должно.

Можно. В разделе "1. Платежные документы".
1. Бланк "Платежное поручение (импорт)", в стандартной поставке.
2. Бланк "1.1. Клиент-банк, создание хозопераций по выписке банка в формате 1С", в поставке московского дилера КЦ Модус.
Здесь многое чего добавлено к старью из п.1.

Должности, это в кадрах. В файле Н/У нет поля с должностью. В УСН только графа ввода, никуда не записывается. Её надо удалить из УСН, чтоб никого не смущала, или добавить поле и прицепить справочник должностей из кадров.

Думаю, лучше воспользоваться бланком ХХХ Анализ структуры базы данных из раздела счетов-фактур.
Все изменения внести в файл ИНИ, а затем изменить структуру БД.