При списании некоторые ТМЦ проходят с минусом

Проверьте проводки.
Может два раза списали?

Проводки проверила в первую очередь.
На каждой операции по одной проводке.

Версия программы сетевая, тогда проверьте базу.
В меню программы Файлы\База данных\Проверить.

Смотрите оборотную ведомость, жхо по этому счету. Там эти минусы и надо искать. Также движение средств по счету