Мои комментарии

Опишите последовательность действий от оприходования до отгрузки, только поподробнее.
Из вашего описания не ясно, из какого оприходования бралась цена.
Когда вы указывали и как приходный документ?

В меню Операции\Счета-фактуры\Настройки раздела есть параметр Загружать цену в цену списания, какое у него значение?

Пересчитайте бланк 2.1 за 1, 2 и 3 месяцы.

Обычно себестоимость товара подставляется после выбора товара и перемещения по строкам с помощью клавиши Enter? Тогда рассчитывается средняя цена и подставляется в цену списания.
Если цена списания стоит ноль, то и проводки не будет.

Поставьте горячие обновления от 04.04.2017

Рассчитайте кому-нибудь зарплату и налоги, а затем удалите расчёт.

Или бланк 5. 7.1 Расчет по страховым взносам - титульный лист, раздел 1(приложения 1-4) в разделе 6. Зарплата
Или бланк 4.11.1 Расчет по страховым взносам - титульный лист, раздел 1(приложения 1-4) в разделе V. Зарплата (оплата труда):4. ФНС - налог на доходы физических лиц
В зависимости от настройки меню.

1. Проверить по F4 параметр Проводки - Формировать.
2. Нажать кнопку Настроить счета для проводок.
Посмотреть, может не все счета присутствуют!

Помощник, однако нужен.
Могу тоже подключиться и посмотреть.
ib@modus.ru

В разделе Зарплата бланк с номером "5.7.1".

Горячие обновления поставили тоже?

Да, там надо указать ваш процент по травматизму.

Сказки какие-то!
Что копировали-то?
Где у Вас находятся данные по зарплате?
Версия программы какая?
Локальная или сетевая?

В параметрах расчёта поставьте дату расчёта позже 23.03.2017

Тогда архивы.
1. Архив при выходе из программы.
2. Архив при подготовке данных в ПФР.
3. Архив при переходе на новый год.
4. Есть ещё архив в BACKUP\ZP

Могли удалить, могли изменить код в плане счетов.
Попробуйте в разделе "6. Зарплата"
пересчитать бланк "Х 3. Проверка кодов работников в плане счетов".
Может найдётся там?
Посмотрите архивы, которые Вы создавали при выходе из программы.

Вопрос больше методический чем программистский. Соответственно нужно определиться с учётной политикой, а потом ставить задачу по закрытию периода.
Мне не понятна статическая аналитика на 10 счёте по контрагенту.
Я не могу представить методику, которой она соответствует.
Следовательно, если будет вменяемая (не противоречивая) методика учёта, то я бы смог изложит соответствующую ей методику закрытия периода.
Поэтому,

вопросов больше чем ответов

P.S. К сожалению, мы так и не услышали начальника транспортного цеха.

Код счёта не может выть пустым.
Вам надо убрать только галочки в Разделе баланса, Активный и Пассивный.

Можете прислать базу на ib@modus.ru?
Посмотрю.

А какие оба?
Надо сказать, привожу скриншот свой - у меня во всех базах разных фирм такая же структура, и все остальные фирмы считает нормально при этом.

Уточню ответ Юрия Владимировича, ВСЕ счету "0".
Предложенную им операцию изменения раздела баланса, надо применить к счёту "0". Все остальные тоже станут забалансовыми.

P.S. Вот грёбаный форум, никак нельзя отвлечься и попить чаю.
Что написано пером, не вырубить и топором.
Монитор жалко, а WEB-мастер далеко.

1. В справочнике выплат есть поле Колонка.
В бланке 1.1 выплаты с одним значением этого поля суммируются.

2. Может вы слишком много выдали?
Посмотрите журнал платежей по этому сотруднику.
Это в меню программы Зарплата/Кадры\Зарплата\Журналы\Платежи.