Мои комментарии

Сейчас нет.
Скоро будет.

По настройке будет.

Вычеты по F4. Взносы какие, дополнительные сотруднику или которые организация отчисляет фондам?

Еще один тип сотрудника должен быть настроен, один на 13, другой на 30.
С иностранными сотрудниками по-другому не получится.

Тип работника "шт" - штатный резидент - будет браться 5.1.
"штнр" - иностранный работник - в зависимости от настроек тарифа для типа - 0 или 5.1 , с "вп" в карточке НУ - 0 или 1.8.

По какой дате будет смотреться, чтобы попадало в квартал.
По письму ФНС должно быть "по сроку перечисления".
Некоторые ИФНС просят "по дате удержания".

Аванс никак не разносится. Он пропускается, если не настроен, т.к. не считается полноценной выдачей. Если с авансов выдаются отпуска, больничные и т.д., то можно в графе "Соответствие начислений и выплат настроить".
"Обработать выдачу ЗП через перевод удержаний" - это если перевод в банк осуществляется через удержание, без выплаты.
"Обработать выдачу аванса" - это ставится только если сотруднику выдали аванс без зарплаты (допустим вся сумма за месяц уложилась в аванс и выдавать в зарплате нечего).

Для  проводок у Вас где-то счет не указан, справочник отделов или справочник начислений.
Взносы поправлю.

"Зарплата - Настройки - Соответствия" - соответствие вычетов и доходов - здесь поставьте "2010-403", потом в карточке вычет поставьте с соответствующим доходом.
И в справочнике начислений для 2010 года - в суммовых полях для фондов 403 вычет, и статью заполните.

Попробуйте настройку по F4 "Вычислять перерыв в стаже".

Редко, но может, при изменении бланка.

Если зарплату выдавали не частями, то в 6-НДФЛ все должно встать на свои места.

Форму для ИФНС сформируйте.
Её предоставляют в печатном виде.
Бланк поправлю.

В начале бланка есть графа "Добавить счет затрат" - введите его туда.

Проверьте правильность проводок по уплате.

Отчетный период поменяйте на 2016 и обратно.

1. Скорее всего, районный коэффициент.
    Меню "Зарплата-Настройки-Коэффициенты".
2. Посмотрите в  меню: "Кадры-Ввод отклонений".

Обновление последнее?

Корректировку по стажу сдаете?
Этот сотрудник в первый отчет не попал или не те данные сдали?

В начале следующей недели. Официально она с 25 марта.