Мои комментарии

Можете прислать на zp@ib.ru
файл, который ИБ формирует?

Если нужна форма для отчета, то нет.
Если только суммы, то можно воспользоваться бланком командировочных.

На это влияет настройка по F4 откуда ОКАТО брать.

Бл или блр ставится при вводе больничного листа.
На НДФЛ это в общем-то не влияет.
Влияет, какое Вы начисление сохранили в карточку и его настройки в справочнике.

Начисление, которое поставили в карточке НУ, у него в справочнике начислений, скорее всего, + стоит в колонке подоходного налога, либо - ставьте, либо другое начисление.

Тип сотрудника не меняли? Это не тарифы, тарифы это налоги предприятия, а это взносы.

Ставка настраивается в меню "Зарплата-Настройки-Взносы предприятия".
В меню "Зарплата-Списки-Взносы предприятия для типов" выбираются взносы для типа.

В хотфиксах.

Хотфикса подождите

Подождать, либо разъяснения выйдут, либо программы проверки обновятся.

Подождите - сегодня хотфикс должен выйти.
Если не поможет, тогда пришлите папку ZP на zp@ib.ru.

Перед отправкой программой CheckPFR проверяли?

А базу не пришлете?

И в СЗВ-М и в ИС РСВ-1.

Возможно, две из них внесены в таблицу особых условий в 7.52, а две - нет.

Хотфикс подождите.

Таблица 3.1 заполняется автоматически если тип соответствует типу иностранца и в карточке НУ стоит статус ВП

Посмотрите обновился ли файл ...PROJECT/MN/MN_4_FSS_2015.IBL ?

040 - это исчисленный доход, и он вычисляется путем перемножения 020, за минусом вычетов в 030, на ставку в 010, он может не совпадать с удержанным в 070.

Попробуйте: Зарплата-Настройки-Общие параметры параметр "типыИностран", к уже имеющемуся добавьте "ВР" через запятую.