Мои комментарии

1. Испортился файл Grtable.db, бывает такое не часто. В папке DATA\SCF не содержится информации по контрагентам, только их ID. Впрочем можно и не присылать. Поставьте наше обновление. Там давно сделана обработка такой ситуации. При каждом входе делается проверка на такую ошибку. Сообщается об этом и предлагается исправить.
Если этого не сделать, то будет затираться информация о ранних счетах-фактурах. Сейчас она и затирается.
Все файлы блока связаны по ID записи в каждом файле. Следующий номер ID как раз и формируется в файле Grtable.db в инкрементном поле (при создании новой записи присваивается очередной номер). Когда происходит сбой, файл начинает отсчёт заново. В результате нарушается целостность базы счетов-фактур.
Любую болезнь надо лечить вовремя.
P.S. Хорошо бы произвести тестирование сетевого оборудования.

1. Оплаты подставляются по датам старые? При заведении нового счёт-фактуры номенклатура для него уже присутствует? Если так, то просто испортилась база. Пришлите на ib@modus.ru папку DATA\SCF. Могу проверить и исправить.
2. Посмотрите в меню Операции\Счета-фактуры\Настройки раздела параметр "Загружать цену в цену списания" поставьте НЕТ.

Для новой декларации нужен новый формат 5.07.

У первого в списке транспортного средства Вы не указали код единицы измерения.
После исправления на 251 Тестер ошибки не показал.
Следовательно, файл выгружается в правильном формате.
Скачать Тестер можно отсюда.
Референт это отдельная песня.
Однажды из-за неправильной его работы, именно по транспортному налогу, на них чуть в суд не подали.

У меня к Такскому доверия нет.
В СБиСе, например можно указать, отправить в любом случае.
Они оставляют за нами право на принятие решения.
Такая же ситуация и с Питерской Сферой.
Любит сама принимать решения.

ИБ не только удваивает сумму налога.

Это исправлено, но не выложено в обновления.

Файл выгрузки загрузила в Референт посмотреть правильность заполнения.
Референт выявил ошибку - файл не соответствует схеме.
Раздел 2 по АТС вообще не выгрузился в референт?

Проверьте тестером.

Приказ ФНС России от 05.12.2016 № ММВ-7-21/668@
Смотрите пункт 3 этого приказа:

Посему, спешить некуда!

Утверждена новая форма декларации по транспортному налогу.
Она уже вступила в силу.
https://www.nalog.ru/rn77/news/tax_doc_news/6393953/
Когда ждать?

Бланк расчёта 4.021 (07а) исправили.
Он выйдет в ближайшем обновлении.
Если нужно срочно, то напишите адрес, я вышлю бланк на почту.

Ближайшее обещанное полное обновление в конце прошлой недели не вышло.
Юрий Владимирович, пожалуйста, пришлите мне на почту исправление по декларации.
Клиенты сильно ждут.
Заранее благодарю!

Можно.
В меню Зарплата/Кадры\Зарплата\Настройки\Шкала вычетов
Сделайте 2 записи.
0 - 1
1 - 0
Очень любит после перехода на новый год удалять эту шкалу.
Оно не действует по закону, но влияет на работоспособность.

Установите перед расчётом бланка, дату возникновения налогового обязательства в 1-м квартале 2017 года.

Установка\План счетов.
У вашей компании наверное убыток в прошлом году?
Нажмите F4 на счёте 0.
Уберите галочки из Раздела баланса. Счёт 0 должен быть забалансовым.

Скорее всего, 2016 год вообще трогать не надо.

Достаточно воткнуть ключ в LPT.

Для Sentinel LPT - SentinelSuperPro.

Это для всех.

Могу только повторить.
Ищите ЖХО и архивы.

У Вас что-то с сетью.
Перезагрузите все компьютеры.

Хотя бы сделать ревизию, где что установлено.
Перечень форматов блоков описан в DOC\Форматы. Для блока счетов-фактур это файл ФорматСФ.XLS.
Вот эти файлы и искать. Потом в найденном проверить содержание.
P.S. Звоните вечером.

Видимо, работала все-таки через второй ярлык.

Вот это обстоятельство наталкивает на мысль о том, что оно где-то есть и надо поискать.
Позвоните в КЦ Модус, я сейчас на месте. Могу подключиться через интернет.

Это у Вас стоит в общей шкале вычетов.
Если нажать Ок, то появится список вычетов.
На нужном вычете надо опять нажать Ок.